相比法律和财务方面的尽职调查，商业尽职调查除关注标的企业存在的风险外，更侧重挖掘标的企业是否存在改善经营、提升业绩的空间，是否能与上市公司现有主营业务产生协同效应，在上市公司收购处于创立初期，盈利能力较弱，业绩不稳定的标的企业过程中商业尽职调查尤为重要。除此之外，商业尽职调查并非独立进行，一方面需要依赖法律和财务方面尽职调查已获取的工作成果和结论（如资产权属、财务报表、收入和成本费用明细账等），另一方面商业尽职调查也可以为法律和财务尽职调查提供新的证据和关注要点。
上市公司对标的企业实施商业尽职调查主要关注的事项包括以下几个方面：
取得标的企业行业主管部门制定的发展规划、行业管理方面的法律法规及规范性文件，了解行业监管体制和政策趋势。了解标的企业所在行业对主要宏观经济指标（GDP、固定资产投资总额、利率、汇率等）变动的相关性和敏感程度，分析标的企业所在行业与其上下游行业的关联度、上下游行业的发展前景、上下游行业变动及变动趋势。
关注标的企业主要产品或服务的市场发展趋势，从供给和需求角度估算市场规模，分析客户购买标的企业主要产品或服务时所看重的关键因素，预测市场发展趋势的延续性和未来可能发生的变化。
获取标的企业主要竞争对手（除现有竞争对手外，应重点关注潜在竞争对手）的资料，包括业务内容、产品明细、市场份额和最新发展动向等，分析标的企业所在市场的竞争环境和进入壁垒，在行业专家的协助下，预计替代产品产生的可能性和导致的竞争后果。
获取标的企业研发、采购、生产、销售、物流配送和售后服务等各个业务环节的资料，了解企业在各业务环节是否设置并有效执行了内部控制程序。通过分析企业如何通过业务流程创造最终产品或服务的附加价值或业务流程如何影响销售收入和利润，确定企业的核心竞争优势和业务流程可以改进的环节。
获取标的企业研发体制、研发机构设置、激励制度、研发人员资历等资料，调查标的企业的研发模式和研发系统的设置和运行情况，分析是否存在良好的技术创新机制，是否能够满足标的企业和上市公司未来发展的需要。了解标的企业对核心技术人员的奖励制度，对关键技术人员是否实施了有效约束和激励，是否有效避免了关键技术人才的流失和技术秘密的外泄。
从业务、产品、区域、客户等视角分析标的企业的业绩驱动因素，通过已获取的财务数据对标的企业的盈利能力、成本构成、资本结构和运营效率进行全面分析。
由于商业尽职调查涉及较多行业与技术方面的专业知识，特别是在跨行业并购中，上市公司对标的企业的产品和业务模式缺乏深入的了解，应聘请技术咨询公司、行业协会、规划设计院等专业机构协助上市公司对标的企业实施商业尽职调查。
