一、马克思主义理论学科设置的特殊性
把握好马克思主义理论一级学科中下属的六个二级学科（马克思主义基本原理、马克思主义发展史、马克思主义中国化研究、国外马克思主义研究、中国近现代史基本问题研究、思想政治教育）之间的内在联系，不仅有利于理顺各二级学科建设的关系，而且也有利于推进整个一级学科的建设。
马克思主义理论一级学科的设立，与其他学科有所不同，有其自身的特殊性。也就是说，各二级学科并不是完全按照学科本身的逻辑和内在关系，也不是完全按照马克思主义理论所包含的内容来设立的。马克思主义理论一级学科和各二级学科的设立，其特殊性表现在以下两个方面。
一是马克思主义理论是在已有相关学科的基础上设立的，因而必须要考虑与其他相关学科的关系。在原有的学科设置中，虽然没有把马克思主义理论作为一个独立的学科，但马克思主义理论的内容在其他学科中早有体现。马克思主义哲学、马克思主义政治经济学、科学社会主义等马克思主义理论早就渗透在其他的学科中。这次把马克思主义理论作为一个独立的一级学科，并没有把在其他学科中的相关的马克思主义理论纳入进来，这些理论内容仍然在其他的学科中。新设立的马克思主义理论一级学科，主要是从整体上研究马克思主义基本原理和科学体系的角度来考虑的，它研究马克思主义基本原理及其形成和发展的历史，研究它在世界上的传播与发展，特别是研究马克思主义中国化的理论与实践，同时把马克思主义研究成果运用于马克思主义理论教育、思想政治教育和思想政治工作。这是马克思主义理论一级学科与其他学科有明显区别的地方。
二是马克思主义理论学科的设立与思想政治理论课改革有着密切的关系。中央确定的思想政治理论课改革“05方案”中的四门必修课：“马克思主义基本原理概论”、“毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论”（原课程为“毛泽东思想、邓小平理论和‘三个代表’重要思想概论”）、“中国近现代史纲要”、“思想道德修养与法律基础”与原有课程相比体现出的一个显著特点就是课程内容趋向综合性。这些课程建设迫切地需要有学科建设来支撑。因此，马克思主义理论一级学科设立的一个重要目标就是为思想政治理论课教育教学提供学科支撑。所以，六个二级学科的设立，基本上是与思想政治理论课的四门课程相对应的。根据思想政治理论课的课程来设置二级学科，这也是其他学科所没有的。这既突出了思想政治理论课程的特色，也体现了马克思主义理论这一学科的特殊性。这是在把握马克思主义理论一级学科和各二级学科关系时必须要看到的。
马克思主义理论学科设置具有的特殊性，决定了在把握这一学科和进行学科建设的过程中，必须要处理好两个关系。
第一，要处理好这一学科与其他学科中马克思主义理论内容的关系。在我国目前的学科设置中，马克思主义理论的内容并不是全部集中在马克思主义理论一级学科中，而是分布在人文社会科学的各个学科中，如哲学、经济学、法学、科学社会主义、历史学等学科中都包含有马克思主义理论。这样，对马克思主义理论的研究，各学科之间既有共性和交叉点，又各有侧重点。各学科中研究的都是马克思主义理论，但又有所不同。其他学科中研究马克思主义理论主要是从本学科的角度，对马克思主义理论进行分门别类的研究，如马克思主义哲学、马克思主义政治经济学、马克思主义政治学、马克思主义法学等。而马克思主义理论学科研究的内容尽管也涉及这些内容，但主要的不是从各具体学科的角度来研究，而是从整体上研究马克思主义基本原理和科学体系，强调的是整体和综合，这是二者的重要区别。马克思主义理论与其他学科中涉及的马克思主义理论的具体内容，相互之间并不是排斥的，而是融合和互补的，是从不同的角度对马克思主义理论的研究。我们不能因为设立了马克思主义理论一级学科以后，就削弱了对马克思主义理论分门别类的研究，也不能因为有了其他学科对马克思主义理论分门别类的研究，就不重视对马克思主义理论的整体性和综合性研究，二者缺一不可。当然，马克思主义理论学科主要的还是应该把重点放在对马克思主义理论的整体性和综合性研究上。
正因为有这样的关系，在进行马克思主义理论学科建设的过程中，如何把握与其他学科研究马克思主义理论的区别，是需要深入研究的问题。如果不能很好地把握马克思主义理论学科建设与其他学科研究马克思主义理论的区别，就不能体现这一学科建设的特点，也难以把握与其他学科的不同侧重点。
第二，要处理好这一学科与思想政治理论课的关系。设立马克思主义理论一级学科的一个重要目标，就是要服务于思想政治理论课的教育教学，为其提供有力的学科支撑，在实践中这二者也有着密不可分的关系。所以，进行马克思主义理论学科建设，不能离开思想政治理论课建设的需要，不能把学科建设与课程建设看作是两件互不相关的事情，否则，就不符合设立马克思主义理论学科的初衷，学科建设也就在很大程度上失去了它的意义。但是，又不能把学科建设等同于课程建设，学科建设有其自身的规律，课程建设也有其自身的规律。所以，既不能用学科建设替代课程建设，也不能用课程建设替代学科建设。必须要按照学科建设与课程建设各自的规律，来推进学科建设和课程建设。这里的关键是要做到二者的有机结合。如何做到有机结合，这又是一个很值得研究的问题，它涉及各方面的关系，其中很重要的一个内容，就是学科建设体制与课程建设体制的问题。就学科建设与课程建设的内容来看，包括教学的结合、科学研究的结合、队伍建设的结合、基本建设的结合等，当然，最重要的是学科建设和课程建设这两支队伍的结合。总起来说，学科建设必须始终考虑课程建设的要求，把服务于思想政治理论课作为一项基本的任务。为了使课程建设从学科建设中得到更多的支持，同时也为学科建设提供广阔的发展平台，我们对学科建设与课程建设的体制问题要作深入研究。
