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亚细胞组分分离技术

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亚细胞组分分离技术

    

    (一)实验目的及原理

    细胞由细胞膜、细胞核和细胞质组成,细胞质中含有若干细胞器和细胞骨架等,这些也称作亚细胞组分。对于细胞的结构和功能的研究,是细胞生物学的基本课题,其研究手段之一是分离纯化亚细胞组分,观察它们的结构、功能或进行生化分析。分离亚细胞组分的方法主要有差速离心和密度梯度离心(图1-53)。

    (二)实验试剂

    1.实验储存液

    (1)100mmol/LEDTA:3.36gEDTA溶于100ml去离子水,室温保存。

    (2)100mmol/LPMSF:174mgPMSF溶于10ml异丙醇,如需要超声震动混匀,室温避光保存。

    (3)PIPES缓冲液:配制4×和10×储存液,0.45μmol/L滤器过滤,4℃冰箱保存(表1-14)。

    2.不同组分提取液

    (1)皂苷提取液(0.015%,pH6.8,4℃保存):加热搅拌溶解18.75mg皂苷于10ml4×储存液,然后加入1mlPMSF,联合加入15ml4×PIPES缓冲液和5mlEDTA,加入去离子水定容至100ml。

    

图1-53 细胞不同组分分离法

表1-14 PIPES缓冲液

    

    (2)Triton X-100提取液(0.5%,pH7.4,4℃保存):加入25ml4×PIPES缓冲液,1mlPMSF,3mlEDTA,5ml新配制的10%TritonX-100,定容至100ml。

    (3)Tween/DOC提取液(1%Tween/0.5%DOC,pH7.4,4℃保存):分别用2.5ml10×PIPES缓冲液,溶解0.5gDOC和1mlTween-40,将两者混合,加入1mlPMSF,定容至100ml。

    (4)细胞骨架溶解缓冲液(CSK)(5%SDS,10mmol/L Na3PO4,pH7.4)。

    ①非还原性缓冲液:5ml20mmol/LNa3PO4缓冲液中溶解0.5gSDS,加入去离子水定容至10ml。

    ②变性缓冲液:在非还原性缓冲液中加入1mlβ-巯基乙醇,定容10ml。

    (三)实验流程

    1.细胞准备

    (1)悬浮细胞

    ①离心:1300r,5min离心沉淀细胞,弃上清。

    ②洗涤:加入2ml预冷PBS,重悬细胞沉淀。

    ③离心:1300r,5min离心沉淀细胞,弃上清。

    ④提取:加入组分提取试剂,5倍体积于沉淀。

    (2)贴壁细胞

    ①洗涤:加入2ml预冷PBS洗涤细胞。

    ②提取:以25cm×25cm细胞培养瓶为例,每瓶细胞加入组分提取试剂1ml。

    2.组分提取

    (1)细胞质组分(皂甙提取)

    ①细胞准备完毕,加入4℃预冷皂苷提取液。

    ②将混合物至于冰上于摇床孵育5~10min,台盼蓝排除实验确定95%~100%的细胞膜通透性发生改变。

    ③对于悬浮细胞,2170r离心5min,保留上清液,保存于-70℃冰箱,留取沉淀用于下一步实验。

    ④对于单层贴壁细胞,倾斜培养瓶,吸出胞质蛋白提取物,记录体积,保存于-70℃冰箱。

    (2)细胞膜及细胞器组分(Triton X-100提取)

    ①对于悬浮细胞加入皂苷提取液等量的TritonX-100提取液,轻柔重悬沉淀,充分混匀。

    ②对于单层贴壁细胞,加入1mlTritonX-100提取液。

    ③将混合物至于冰上于摇床轻柔震动孵育30min。

    ④对于悬浮细胞,6816r离心10min,保留上清液,保存于-70℃冰箱,留取沉淀用于下一步实验。

    ⑤对于单层贴壁细胞,倾斜培养瓶,吸出胞膜及细胞器蛋白提取物,记录体积,保存于-70℃冰箱。

    (3)细胞核组分(Tween/DOC提取)

    ①对于悬浮细胞加入Triton X-100的1/2容量的Tween/DOC提取液,轻柔重悬沉淀,充分混匀。

    ②8002r离心5min,保留上清液,保存于-70℃冰箱,留取沉淀用于先一步实验。

    ③对于单层贴壁细胞,加入0.5~1mlTween/DOC提取液。

    ④对于单层贴壁细胞,倾斜培养瓶,吸出胞膜及细胞器蛋白提取物,记录体积,保存于-70℃冰箱。

    (4)细胞骨架及核基质组分

    ①将不溶于上述提取液的剩余细胞碎片,用1.2mmol/L的PMSF(pH7.4的PBS配制)充分混匀洗涤。

    ②10629r离心10min,机械剪切DNA。

    ③悬浮细胞剩余沉淀用-20℃预冷的90%丙酮充分洗涤,低温离心,上清保存于70℃冰箱。

    ④单层贴壁细胞用PBS原位冲洗,不溶于提取液的的组分用不含β-巯基乙醇的CSK溶液重悬,保存于-70℃冰箱。

    参考文献

    [1]Ramsby and Makowski.Differential Detergent Fractionation of Eukaryotic Cells.The Proteomics Protocols Handbook.2005,37-48.

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