核酸与蛋白质是构成生物体的主要大分子。随着人类基因组等大量生物体全基因组序列的破译和功能基因组研究的展开，生命科学家越来越关注如何用基因组研究的模式开展蛋白质组学的研究，认为蛋白质组学将成为新世纪最大战略资源——人类基因争夺战的战略制高点之一。
●蛋白质组计划
国际人类蛋白质组计划（HLPP）是继国际人类基因组计划之后的又一项大规模的国际性科技工程。首批行动计划包括由中国科学家牵头的“人类肝脏蛋白质组计划”和美国科学家牵头的“人类血浆蛋白质组计划”。“国际人类蛋白质组计划”的总部设在中国首都北京，这是中国科学家第一次领导执行重大国际科技协作计划。由美国科学家吉尔伯特·欧曼牵头的HPPP是第一个人体体液的蛋白质组计划，由中国贺福初院士牵头的HLPP是第一个人类组织／器官的蛋白质组计划。其科学目标是：揭示并确认肝脏的蛋白质；在蛋白质水平规模化注解与验证人类基因组计划所预测的编码基因；实现肝脏转录组、肝脏蛋白质组、血浆蛋白质组及人类基因组的对接与整合；揭示人类转录、翻译水平的整体、群集调控规律；建立肝脏“生理组”、“病理组”；为重大肝病预防、诊断、治疗和新药研发的突破提供重要的科学基础。几年来，围绕人类肝脏蛋白质组的表达谱、修饰谱及其相互作用的连锁图等九大科研任务，我国科学家已经成功测定出6 788个高可信度的中国成人肝脏蛋白质，系统构建了国际上第一张人类器官蛋白质组“蓝图”；发现了包含1 000余个“蛋白质-蛋白质”相互作用的网络图；建立了2 000余株蛋白质抗体。
对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，蛋白质是生命活动的执行体，如果了解了每种蛋白质如何影响人类的健康，科学家们就可以发明治疗疾病的新方法。
蛋白质组学虽然问世时间很短，但已经在研究细胞的增殖、分化、异常转化、肿瘤形成等方面进行了有力的探索，涉及到白血病、乳腺癌、结肠癌、膀胱癌、前列腺癌、肺癌、肾癌和神经母细胞瘤等，鉴定了一批肿瘤相关蛋白，为肿瘤的早期诊断、药靶的发现、疗效判断和预后提供了重要依据。
肝病是一种几乎肆虐了大半个地球的人类公敌。目前，全球仍以每年新增肝炎病患者约5 000万人的速度递增。我国和大多数亚洲国家一样是个肝脏病多发国，有超过1亿人患肝病。每年死于肝病的人有数十万之多，乙型肝炎病毒携带者占人口的比例相当高。全国一年所花费的防治经费高达1 000亿元以上，数额巨大。人类肝脏蛋白质组计划的实施，将极大地提高肝病的治疗和预防水平，降低医疗费用。同时，将使我国在肝炎、肝癌为代表的重大感病的诊断、防治与新药研制领域取得突破性进展，并不断提高我国生物医药产业的创新能力和国际竞争力。
在应用研究方面，蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。
