目前，国家对集体企业和股份合作制企业公司制改造尚未作出具体、明确的规定，甚至可以说是个空白，因此，集体企业和股份合作制企业如何进行公司制改造，只能是摸着石头过河。值得庆幸的是，国家对国有企业改制的管理制度相对完善，从而给集体企业和股份合作制企业公司制改造提供了借鉴作用。
集体企业的产权是由农村社员集体持有并登记在集体名下（一般是农村合作社或村委会），要将集体企业改制为有限公司，则首先必须将集体成员产权进行评估、转让，吸收新的股东，从而将集体企业改制为有限公司。
股份合作制企业，是指以企业职工出资为主或者全部由企业职工出资构成企业法人财产，合作劳动，民主管理，按劳分配和按股分红相结合的企业法人。股份合作制企业是我国国有小企业和集体企业改制的重要形式。
股份合作制是在改革中群众大胆探索、勇于实践的重大成果。股份合作制企业既不是股份制企业，也不是合伙企业，与一般的合作制企业也不同，是在实践中产生并不断发展完善的新型的企业组织形式。
股份合作制在一定的历史时期具有进步意义，并且对我国国有小企业和集体企业改制做出贡献，但从公司法角度看，股份合作制毕竟不是公司制的企业，因此，股份合作制在法律上仍然有其不足的一面，这也正是股份合作制公司制改造的原因或动力。
股份合作制企业公司制改造，与其他企业公司制改造一样，也必须架设股东，而架设股东的方式，可以通过以下两种方式：一是对原职工股改造为股东持股；二是将职工股全部或部分进行评估、转让，不转让部分的职工股改造自然人股东持股。
根据以往实践经验，我们介绍集体企业改制重组基本流程如下：
一、企业改制申请
制订改制方案，说明企业基本情况、改制目标和改制形式（改制方案内容大致与国有企业改制方案内容相同）。
二、成立改制小组
成立企业改制小组，改制小组成员由参加改制的企业厂长（经理）、主管财务的副厂长（副经理）、党委（总支、支部）书记、工会主席及财务人员以及各中介机构（包括律师、会计师）参加。
三、可行性研究论证
由企业改制小组研究讨论企业改制的可行性，即：对企业的现状、存在问题、改制目的、改制的初步设想等相关问题进行充分的论证。
四、征求职工和债权人意见
（一）集体企业改制作为企业的一项重大决策，涉及集体成员切身利益。改制方案必须通过集体大会审议，未经审议的方案不得实施。
（二）为了防止企业债务悬空，企业重组转制必须获得最大债权人的同意。根据《国务院关于在国有中小企业和集体企业改制过程中加强金融债权管理的通知》（国发明电〔1998〕4号）规定，集体企业改制，必须征得金融债权人同意，未经金融债权人同意，不得进行改制。
五、改制方案应递交主管部门批准
集体企业的改制应向主管部门及县（市）区人民政府报送改制方案，在取得批准后方可进入改制工作。
六、清产核资
参照国务院国有资产监督管理委员会制定的《国有企业清产核资办法》，集体企业改制，必须经中介机构对企业进行财务清理、资产清查、损益认定、资金核实等，对各类资产进行全面认真的清查，以保证账账相符，账证相符，账务的全面、准确和真实。要按照“谁投资、谁所有、谁受益”的原则，核实和界定国有资本金及其权益，其中国有企业借贷资金形成的净资产必须界定为国有产权。企业改制中涉及资产损失认定与处理的，必须按有关规定履行批准程序。改制企业法定代表人和财务负责人对清产核资结果的真实性、准确性负责。
七、产权界定
集体企业公司制改造也应当进行产权界定。由县级人民政府或相关部门在财产清查的基础上对企业现有的财产权进行甄别和确认企业全部财产拥有的权益。
八、财务审计
由主管部门决定聘请具备资格的会计师事务所进行财务审计。按照国家有关规定对企业法定代表人进行离任审计。改制企业必须按照有关规定向会计师事务所或政府审计部门提供有关财务会计资料和文件，不得妨碍其办理业务。任何人不得授意、指使、强令改制企业会计机构、会计人员提供虚假资料文件或违法办理会计事项。
九、资产评估
（一）依据2001年财政部《国有资产评估若干问题的规定》，集体企业整体或部分改制为有限责任公司、股份有限公司，应当进行资产评估。
（二）企业的资产评估，由直接持有集体产权的单位决定聘请具备资格的资产评估事务所。
（三）资产评估要严格履行有关法律、法规规定的程序。企业的专利权、非专利技术、商标权、商誉等无形资产必须纳入评估范围。
（四）集体企业资产评估结果应由主管部门核准、确认。
十、进入产权市场交易
集体企业产权转让要进入产权交易市场，并按照《企业国有产权转让管理暂行办法》的规定，公开企业信息，竞价转让。到市产权交易所办理交割。
十一、召开第一次股东大会
首次股东会议由出资最多的主发起人召集和主持。股东大会的主要议程：
（一）由主发起人负责向全体股东作企业转制工作情况报告（汇报企业转制情况及费用支出情况）。
（二）讨论通过企业章程（股东签字）。
（三）选举产生董事会成员。拟定董事会由＿＿名董事组成，由主发起人提出建议名单，交股东大会通过产生。
（四）选举产生监事会成员。拟定监事会由＿＿名监事组成，由主发起人提出建议名单，交股东大会通过产生。
（五）召开董事会、监事会。推荐董事长、监事会主席。
（六）董事会聘任总经理和总会计师、总工程师、总经济师。
十二、办理工商登记手续
（一）准备向工商部门提供的材料。
（二）准备办理资质转移应提交的材料。
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