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第一节中国生物医学文献服务系统(

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第一节中国生物医学文献服务系统(

    第一节 中国生物医学文献服务系统(SinoM ed)

    一、概况

    中国生物医学文献服务系统(SinoMed)是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献服务系统。该系统整合了中国生物医学文献数据库(CBM)、西文生物医学文献数据库(WBM)、北京协和医学院博硕学位论文库等多种资源,是集文献检索、全文下载、定题服务、文献传递等功能于一体的生物医学中外文整合文献服务系统。首页界面(见图2-1-1)显示了系统内各数据库的情况。

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    图2-1-1 中国生物医学文献服务系统主界面

    二、中国生物医学文献数据库

    (一)概况

    中国生物医学文献数据库(CBM)收录1978以来1 600余种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇,年增文献40余万篇,学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域,是目前检索国内医学文献的权威数据库之一。

    数据库的全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版《医学主题词表》、中国中医研究院中医药信息研究所的《中国中医药学主题词表》以及《中国图书馆分类法(医学专业)》进行主题标引和分类标引。

    (二)数据库结构

    数据记录是由30多个字段构成的,如图2-1-2所示。每条记录包含字段数又根据数据信息情况有所增减。

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    图2-1-2 CBM数据库中详细格式示例

    (三)检索功能与方法

    1.基本检索功能

    基本检索是系统默认的检索方式,选择登入本数据库后即进入该界面,如图2-1-3所示。界面可以分为两个部分:一个为检索入口的切换栏,一个为检索执行栏。

    确定检索字段后,输入检索词,点击“检索”按钮即可。系统有“智能检索”选项,其中一些字段还可以进行“精确检索”;如检索结果过于宽泛,可以使用“二次检索”逐步缩小检索范围。该功能可以反复使用,直到获得合适的检索结果。

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    图2-1-3 基本检索界面

    2.词表辅助检索方法

    (1)主题词检索

    1)点击“主题检索”,进入主题词检索状态。

    2)在检索入口的下拉菜单中选择所要使用的主题词类型,有中文主题词与英文主题词两种。

    3)在检索式输入框中输入检索词如“多小脑回畸形”,点击“查找”按钮或直接回车,系统即进入主题词浏览状态,如图2-1-4所示。此时可看到相关主题词有一个“皮质发育畸形”。

    4)点击要检索的词,可以看到此主题词的英文名称以及相关的树状结构,如图2-1-5所示。

    5)选择检索选项:“不扩展”表示仅对单个主题词进行检索;“扩展全部树”表示对当前的主题词及其下位类主题词进行检索;“加权”表示对主题词进行加权检索(主要概念主题词或带星号主题词);“副主题词”是用于对主题词的某一特定方面加以限制,强调主题词概念的某些专指方面,如“肺炎/药物疗法”表明文章并非讨论肺炎的所有方面,而是讨论使用药物治疗肺炎的情况;副主题词扩展检索:一些副主题词之间也存在上下位关系,如副主题词“副作用”的下位词包括“中毒”和“毒性”,选择“扩展副主题词”,指对该副主题词及其下位副主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前副主题词“副作用”。

    6)执行检索:在主题词注释界面,根据课题的实际需要对检索词进行扩展或加权检索,针对不同的课题,可以选择合适的副主题词,副主题词的选择可以是多项的,在选择结束后按“主题检索”按钮,系统自动对该词进行检索。

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    图2-1-4 主题词选择

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    图2-1-5 主题词注释

    (2)分类检索

    该检索界面提供类名与分类号两种检索入口。如选择的是分类词检索入口,可以获得该分类词的详细注释,在该界面中可以对分类词进行扩展检索或者复分,如图2-1-6所示。

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    图2-1-6 分类词注释

    在分类检索界面中,系统提供分类导航功能。根据要检索的内容,来判断可以使用哪个类目,直接点击该类目即可进入分类检索界面。如果需要的为子类目,则点击类目前的“+”,进入下级类目,直到选到合适的类目后,点击类目名称,即可进入分类检索界面。

    (3)期刊检索

    1)在期刊检索中,系统提供“刊名”、“出版单位”、“出版地”、“主题词”四个检索入口,通过输入检索词,可获得对应的检索结果。

    2)期刊导航:通过逐级浏览,或者直接从刊名、出版地、出版单位及期刊主题词等入口检索到期刊,即可浏览该刊的基本信息并进行检索。

    (4)作者检索

    1)点击“作者检索”,进入作者检索状态。

    2)在检索输入框键入完整的作者名或作者名片段,选择是否为“第一作者”后,点击“下一步”按钮,系统显示包含检索词的作者列表。

    3)选择作者名,检索出该作者的所有文献。

    4)选择作者单位:如果是“第一作者”检索,会出现作者单位列表,需要进一步选择作者单位,完成检索,可以通过此限定来进一步精确同名作者文献的检索。

    3.辅助检索功能

    (1)限定检索

    “限定检索”是把年代、文献类型、研究对象等常用的限定条件整合到一个界面,方便检索。

    限定检索在基本检索界面中进行限定,如图2-1-7所示。在检索前与检索后,均可以根据实际情况使用限定检索。在选定限定条件后,限定条件开始执行,可以正常进行检索,如果需要取消限定条件,进入限定检索界面,点击“清除”按钮后,限定条件即清除成功。

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    图2-1-7 限定检索界面

    在使用限定检索时,限定条件的组内关系为“OR”,组间关系为“AND”。限定条件一旦使用,在没有清除前,将一直存在。

    (2)检索历史

    该功能主要用于查看检索策略与检索结果的数量。点击“检索历史”进入,该界面按照时间顺序从上到下依次显示检索式,最新的检索式总在最上方,如图2-1-8所示,一次检索能够保存最多100条检索表达式。对于不需要的检索策略,可以选中后,点击“清除检索史”按钮进行清除。对于已存在的检索策略,还可以将检索序号再进行“AND”、“OR”、“NOT”的组配,从而得到更准确的检索结果。

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    图2-1-8 检索史界面

    (3)定题检索

    该功能可自己定制和跟踪某一课题的最新文献。在使用该功能时,首先要注册成为CBM的用户。拥有个人账户后,可以把完整的检索过程存储到自己账号下。当需要追踪同一个课题时,再登录个人账户进入“我的空间”,调用以前存储的检索表达式,系统将按照指令(点击“最新文献检索”按钮),根据检索式检索出自上次检索日期至今的新记录,这样就能及时、便捷地获得新的文献。

    4.通配符检索

    系统中所用的单字通配符为“?”,它可代替任一半角字符或任一中文字符,如检索式“肝?”,可查出肝癌或肝炎等记录;任意通配符为“%”,替代任意个字符,如检索式“肝炎%疫苗”,可检索出含有以下字符串的文献:肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等。但是需要注意,在使用“%”时,要注意对选词的控制,以免造成检索结果噪声过大。

    (四)结果的显示与保存

    1.结果显示

    在检索结束后,系统会自动转换到结果显示界面,如图2-1-9所示。可以根据需要选择显示格式,系统提供“题录”、“文摘”、“详细”三种格式和“显示标记”或“显示全部”两种显示方式,还提供每页显示条数与排列格式的选项。

    在对检索结果的筛选过程中,可以对文献进行标注,选择后点击“显示标记”按钮,即可对标注的记录进行单独显示。目前,CBM与维普全文数据库链接,可直接下载全文。

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    图2-1-9 检索结果的显示与保存界面

    2.结果处理

    对文献进行筛选后,可以进行检索结果的保存、打印和Email发送。

    (五)检索举例

    例1 检索高血压的预防方面的文献。

    课题分析:根据课题可知所要检索的主要概念是高血压,而且是预防方面的文献。

    概念转换:在主题词表中,找到“高血压”是主题词,通过主题词注释了解到高血压还有恶性高血压、妊娠性高血压、肾性高血压三个下位类主题词,如果检索包含这三方面的内容,在检索时就要考虑扩展检索;在其副主题词选项中可见有关于预防文献的副主题词“预防与控制”(副主题词缩写为PC)。

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    通过对此课题的检索,可以注意到三个问题:一是在检索尽量通过主题词表辅助来选用主题词和副主题词,如果在主题词表中找不到确切的主题词来表达所检索的概念,可采用自由词进行检索;二是当课题的检索概念较大时,应注意是否需要对主题词的下位类词进行扩展检索,一般情况下,系统默认的就是扩展检索,若不需要扩展检索,要在主题词表辅助检索时的检索选项中选中“不扩展”;三是当所查文献是主题词某一方面的文献时,要用确切的副主题词对主题词进行限定。

    例2 胃癌的多药耐药的研究。

    课题分析:此课题的主要概念词是“胃癌”和“多药耐药”,二者间的关系应该是逻辑“与”的关系。

    概念转换:在主题检索输入框内输入“胃癌”,系统匹配出其主题词为“胃肿瘤”;输入“多药耐药”,系统不能匹配出主题词,这时应考虑使用部分关键词“多药”进行主题词转换,输入“多药”后,在系统匹配的相关主题词中找到其主题词为“抗药性,多药”。

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    通过对此课题的检索,可注意到,检索课题的两个主题词均用全部副主题词进行限定。其原因为,当用主题词检索无法确定选用一个或几个确切的副主题词来表达检索含义,或一个课题有两个或两个以上主题概念,并且两者间的逻辑关系为“与”时,应优选全部副主题词来限定,以免漏检。

    例3 检索C-sis和VEGF-A在卵巢癌病人体内表达方面的文献。

    课题分析:根据检索课题可知,所检索的主要概念有三个: C-sis、VEGF-A、卵巢癌。该课题中三个主要概念间的逻辑关系选择,是该课题的重点。一般情况,前两者应是逻辑“或”的关系,而它们的命中文献和与卵巢癌应是逻辑“与”的关系;但是若有特定目的的检索,三个主要概念间也可以根据实际需要选择逻辑关系。

    概念转换:通过主题词表的英文主题词入口,分别输入C-sis与VEGF-A,可查找到相关的主题概念为“原癌基因蛋白质C-sis”、“血管内皮生长因子A”,通过中文检索入口输入“卵巢癌”,可知其主题词“卵巢肿瘤”。

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    通过对此课题的检索,可以注意到当检索课题有两个或两个以上的检索概念时,一定要注意各个检索概念间的逻辑关系的选择,以避免文献的漏检。

    三、其他数据库

    1.北京协和医学院博硕学位论文库

    该数据库收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业。该数据库检索方法基本与中国生物医学数据库相同,在该数据库中可以进行“导师检索”。

    2.中国医学科普文献数据库

    该数据库收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种,文献总量8万余篇,收录养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。该数据库检索方法与中国生物医学数据库相同。

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